Dateimanagement für semistrukuierte Daten

In einer Kooperation zwischen der Genetischen Epidemiologie (http://www3.i-med.ac.at/genepi/) und der Forschungsgruppe DBIS werden genetischen Ursachen für Erbkrankheiten erforscht. Um bioinformatische Datensätze (Phänotypen & Genotypen) strukturiert und effizient zu verwalten, wurden in Rahmen der Kooperation datenbankbasierte Anwendungen entwickelt.
Viele Daten werden jedoch weiteren in "flachen Dateien" abgelegt, was oft zu einem inkonsistenten Datenaustausch unter Mitarbeitern führt und eine Synchronisierung und Versionierung (Historie) von Dateien (v.a. Textdateien) erschweren. Verfügbare State-of-the-art Protokolle bilden Schnittstellen um gestellte Anforderungen zu erfüllen, sind jedoch oft umständlich in ihrer Benutzung (GIT, SVN) oder für den vorliegenden Anwendungsfall nicht anwendbar (cloudbasierter Ansatz bei Dropbox).

Ziel dieser Arbeit war es die oben erwähnten Ansätze zu evaluieren, weiters eine grafische Oberfläche zur Darstellung, Verwaltung und Bearbeitung von Text-Dateien zu implementieren (mit Erweiterung auf binäre Dateitypen), die eine automatische Protokollierung von Änderungen und eine Versionierung von unterschiedlichen Daten über Mitarbeitern hinweg ermöglicht.